Военный музей Жижков входит в состав Военно-исторического института армии Чехии. Здание музея разделено на пять основных блоков, четыре из которых посвящены определенному периоду истории и составляют постоянную экспозицию Военного музея, а пятый блок используют для проведения временных тематических выставок.
Первый зал Военного музея посвящен периоду Первой мировой войны 1914-1918 годов, когда чехи и словаки боролись за свою независимость. Представлены пистолеты, артиллерийские орудия и снаряды, пулеметы и гранаты, военная форма тех лет. Помимо оружия тут можно увидеть флаги, награды и ордена, медицинское оборудование полевых госпиталей, письма солдат и много других мелочей, рассказывающих не только о военных действиях, но и о суровом военном быте тех лет.
Второй блок экспозиции рассказывает о жизни армии Чехословакии с 1918 по 1939 годы. Нельзя сказать, что это было тихое мирное время для страны: вооруженные конфликты с Польшей и Венгрией, борьба за сохранность своих границ, укрепление суверенитета – все это требовало определенный военных усилий. Тут можно увидеть личные вещи генерала Мориса Пеппе и Рудольфа Медке.
Экспонаты третьего зала рассказывают о периоде Второй мировой войны, когда Чехословакия была оккупирована Германией. Помимо военной техники того времени, здесь представлены документальные фотографии военного периода, медальоны солдат, печатная машинка для распространения антиправительственных листовок и многое другое. Часть выставки посвящена деятельности местного Сопротивления и операции «Антропоид», направленной на устранение Рейнхарда Гейдриха.
Четвертый блок экспозиции рассказывает о послевоенном периоде, в частности о февральских событиях 1948 года, Пражской весне и вводе войск Варшавского договора в Чехословакию (операция «Дунай») в августе 1968 года.
